More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2713 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
114 aa  230  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.76 
 
 
117 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  55.34 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  50.45 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 
115 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  50.93 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  46.73 
 
 
115 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  47.66 
 
 
115 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
115 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
258 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  48.18 
 
 
133 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  50.94 
 
 
116 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  54.02 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  49.53 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  50.91 
 
 
118 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
110 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.14 
 
 
113 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.14 
 
 
113 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  54.05 
 
 
134 aa  104  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 
124 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.14 
 
 
113 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  51.11 
 
 
113 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  48.6 
 
 
115 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  55.56 
 
 
111 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  48.6 
 
 
115 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  49.09 
 
 
145 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  45.37 
 
 
114 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  55.56 
 
 
111 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  57.65 
 
 
140 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
114 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  52.43 
 
 
117 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
114 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 
110 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.98 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48 
 
 
117 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.57 
 
 
106 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.53 
 
 
117 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.53 
 
 
117 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 
114 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.53 
 
 
117 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  46.53 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  46.53 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  46.53 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  43.52 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  43.52 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  43.52 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
114 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
275 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.5 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  41.51 
 
 
248 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.28 
 
 
270 aa  90.5  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
120 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  39.81 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.37 
 
 
305 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  48.19 
 
 
89 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  58.21 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  52.24 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  52.24 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  46.27 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  46.27 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  46.27 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  49.25 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.44 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>