More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1808 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 522 aa  1039    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  99.62 
 
 		 522 aa  1036    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4364  AMP-dependent synthetase and ligase  66.67 
 
 		 500 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 522 aa  1039    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  66.47 
 
 		 500 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1743  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1762  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1809  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.318036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4363  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 		 515 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1981  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 524 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 559 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2960  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 513 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.958907  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2696  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2666  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2711  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 513 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.14 
 
 		 510 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3245  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 519 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0034073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  28.93 
 
 		 552 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.26 
 
 		 550 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 533 aa  193  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 544 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  29.02 
 
 		 549 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  28.89 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 532 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.44 
 
 		 549 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.44 
 
 		 552 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 1043 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  31.4 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5429  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 566 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  28.26 
 
 		 549 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.76 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4634  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 557 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  29.13 
 
 		 560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.93 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  30.06 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0324  putative AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.99 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.61 
 
 		 538 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 489 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 498 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  30 
 
 		 539 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 		 552 aa  183  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  27.94 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  30.48 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  28.31 
 
 		 547 aa  181  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 540 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.67 
 
 		 518 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  31.49 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 662 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.15 
 
 		 549 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.89 
 
 		 526 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  28.47 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  30.7 
 
 		 576 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  27.96 
 
 		 549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.36 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.42 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.48 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  28.96 
 
 		 578 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  30.17 
 
 		 546 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.8 
 
 		 579 aa  173  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.09 
 
 		 518 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  27.59 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 566 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  27.27 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 630 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  28.76 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  30.21 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.9 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  29.1 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  31 
 
 		 576 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  31 
 
 		 576 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>