More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3245 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2711  AMP-dependent synthetase and ligase  67.33 
 
 		 539 aa  673    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3245  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 519 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0034073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2960  AMP-dependent synthetase and ligase  73.97 
 
 		 513 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.958907  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2666  AMP-dependent synthetase and ligase  67.33 
 
 		 539 aa  673    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2696  AMP-dependent synthetase and ligase  67.72 
 
 		 539 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5429  AMP-dependent synthetase and ligase  64.31 
 
 		 525 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1809  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 518 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.318036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1762  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 518 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1743  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 518 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1981  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4363  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 515 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 522 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 522 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 559 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 522 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3702  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.7 
 
 		 549 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.12 
 
 		 549 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  27.85 
 
 		 560 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  27.64 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  27.47 
 
 		 552 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 		 566 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.12 
 
 		 549 aa  173  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  28.1 
 
 		 548 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0318  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00246923  normal  0.308264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  26.76 
 
 		 549 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 548 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  28.7 
 
 		 549 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  27.47 
 
 		 550 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  28.21 
 
 		 549 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  27.66 
 
 		 552 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  25.37 
 
 		 549 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2266  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  28.28 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  25.95 
 
 		 547 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  27.68 
 
 		 570 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  24.95 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  26.81 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4364  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.29 
 
 		 828 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  27.49 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 		 571 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  27.93 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  26.77 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0324  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 581 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 562 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 525 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  27.49 
 
 		 570 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  27.95 
 
 		 540 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.73 
 
 		 514 aa  156  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  26.33 
 
 		 538 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  27.69 
 
 		 579 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 564 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.99 
 
 		 605 aa  155  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 843 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 508 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4634  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 557 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  26.72 
 
 		 578 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  24.6 
 
 		 566 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 582 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  27.7 
 
 		 540 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  27.7 
 
 		 540 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  25.55 
 
 		 605 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  27.7 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.17 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2539  putative acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 		 546 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  27.86 
 
 		 562 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  27.4 
 
 		 572 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7114  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 		 525 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  27.62 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  30.16 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 1043 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  27.32 
 
 		 573 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.36 
 
 		 516 aa  150  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 533 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  27.97 
 
 		 564 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  26.99 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.8 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  27.62 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  26.71 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>