More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2826 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2799  short chain dehydrogenase  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2826  short chain dehydrogenase  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.315835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2843  short chain dehydrogenase  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11884  short chain dehydrogenase  68.42 
 
 
225 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.302494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3076  short chain dehydrogenase  64.04 
 
 
223 aa  292  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.402808  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3346  short chain dehydrogenase  59.91 
 
 
223 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.29345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
239 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.41753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0114015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1300  short chain dehydrogenase protein  32.13 
 
 
240 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.807678  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.0000984916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 
250 aa  62  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
256 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  25 
 
 
288 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  27.13 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1665  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.81 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.65 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3149  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40900  putative short-chain dehydrogenase  30.17 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.53 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
288 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  26.07 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159825  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  26.91 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.02 
 
 
287 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
285 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
288 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
286 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
286 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  25.91 
 
 
288 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  25.1 
 
 
288 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  29.13 
 
 
313 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170308  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.51 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 
285 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
288 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
270 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.92 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.39 
 
 
252 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  28.11 
 
 
255 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  28.4 
 
 
260 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
249 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
266 aa  58.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
288 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3199  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.14 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
290 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
233 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  25.51 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.87 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.15 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3115  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.86 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389374  normal  0.532099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.39 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.45 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>