More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0876 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  99.56 
 
 
453 aa  927    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  99.56 
 
 
453 aa  927    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 
453 aa  930    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  43.74 
 
 
458 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  42.53 
 
 
451 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  40.83 
 
 
453 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  43.34 
 
 
457 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  43.12 
 
 
457 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  43.34 
 
 
457 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  41.86 
 
 
453 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  41.02 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  40.5 
 
 
452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  40.76 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  40.89 
 
 
451 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  40.89 
 
 
451 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  40.67 
 
 
451 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  34.55 
 
 
444 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  35.76 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  36.05 
 
 
441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  31.83 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  34.54 
 
 
464 aa  239  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  33.03 
 
 
444 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  34.16 
 
 
442 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  32.79 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  33.41 
 
 
480 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  32.19 
 
 
444 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  31.29 
 
 
446 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  32.57 
 
 
434 aa  229  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  33.64 
 
 
432 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  32.27 
 
 
435 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  32.51 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  33.86 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  31.59 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  31.15 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  34.53 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.85 
 
 
444 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 
442 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.09 
 
 
445 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  31.59 
 
 
432 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  33.55 
 
 
448 aa  216  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  33.33 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  32.6 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  32.87 
 
 
432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.61 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  31.24 
 
 
461 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  31.29 
 
 
432 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  32.27 
 
 
452 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  33.85 
 
 
456 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  31.42 
 
 
435 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.02 
 
 
444 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  32.15 
 
 
438 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  32.06 
 
 
443 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.54 
 
 
442 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 
451 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  32.44 
 
 
443 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  30.96 
 
 
440 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 
451 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.54 
 
 
449 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  33.33 
 
 
453 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  30.5 
 
 
435 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 
436 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 
436 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  33.93 
 
 
448 aa  203  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 
436 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  33.19 
 
 
456 aa  203  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  32.22 
 
 
444 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.11 
 
 
447 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  33.1 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  31.72 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  30.73 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  32.74 
 
 
442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  33.03 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.05 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  31.76 
 
 
444 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  31.29 
 
 
459 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  30.94 
 
 
442 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  35.27 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  32.3 
 
 
447 aa  197  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 
445 aa  196  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 
444 aa  196  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  31.65 
 
 
446 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.21 
 
 
443 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  35.02 
 
 
453 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.81 
 
 
443 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  35.32 
 
 
456 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  34.37 
 
 
445 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  31.36 
 
 
444 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  31.85 
 
 
461 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  30.75 
 
 
442 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.94 
 
 
450 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
444 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  30.67 
 
 
446 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>