More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1032 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1032  prephenate dehydratase  100 
 
 
264 aa  547  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.506723  normal  0.948926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1561  prephenate dehydratase  51.89 
 
 
264 aa  265  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1299  prephenate dehydratase  48.83 
 
 
263 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2607  Prephenate dehydratase  50.38 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0598  prephenate dehydratase  50.38 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00579273  normal  0.0174836 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  38.29 
 
 
311 aa  148  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  35.98 
 
 
272 aa  148  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  37.92 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  34.59 
 
 
278 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.49 
 
 
371 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  37.12 
 
 
268 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.89 
 
 
284 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.7 
 
 
365 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.24 
 
 
364 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  35.88 
 
 
382 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  38.11 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  35.86 
 
 
269 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.39 
 
 
367 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  36.55 
 
 
364 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  36.55 
 
 
364 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  36.43 
 
 
371 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  35.44 
 
 
269 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.82 
 
 
364 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  35.86 
 
 
269 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  37.39 
 
 
364 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37.82 
 
 
364 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  36.55 
 
 
364 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.96 
 
 
362 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  37.5 
 
 
365 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.84 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.71 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  34.53 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.21 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  35.88 
 
 
365 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  34.69 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  34.57 
 
 
280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  37.02 
 
 
373 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  34.44 
 
 
357 aa  131  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  32.96 
 
 
359 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  29.82 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  29.82 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.08 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.08 
 
 
387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  34.17 
 
 
358 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  29.45 
 
 
277 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.17 
 
 
358 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  35.71 
 
 
397 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.44 
 
 
358 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  34.44 
 
 
276 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  36.12 
 
 
393 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  37.22 
 
 
288 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  36.94 
 
 
288 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  35.36 
 
 
393 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.09 
 
 
356 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  35.29 
 
 
291 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  31.32 
 
 
379 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  33.33 
 
 
359 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  32.96 
 
 
382 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  31.85 
 
 
277 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  31.65 
 
 
293 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  33.76 
 
 
359 aa  122  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.19 
 
 
359 aa  122  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  31.46 
 
 
359 aa  121  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  31.58 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  34.93 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  32.84 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  31.72 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  34.78 
 
 
372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.73 
 
 
370 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  31.03 
 
 
418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  32.57 
 
 
371 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0983  Prephenate dehydratase  31.34 
 
 
272 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.432859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.61 
 
 
368 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  34.18 
 
 
281 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  32.95 
 
 
355 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  38.46 
 
 
362 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  32.1 
 
 
287 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.73 
 
 
392 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  31.09 
 
 
359 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.26 
 
 
367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  29.92 
 
 
381 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.47 
 
 
357 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  32.57 
 
 
371 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  30.51 
 
 
360 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  31 
 
 
392 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  34.58 
 
 
360 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  32.3 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  34.19 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  34.42 
 
 
372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.23 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  32.45 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  30.86 
 
 
356 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  35.1 
 
 
391 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  32.35 
 
 
358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  31.78 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  33.09 
 
 
373 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.06 
 
 
371 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  33.88 
 
 
281 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  29.32 
 
 
359 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.87 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>