58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5421 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  80.14 
 
 
426 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  816    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  80.14 
 
 
426 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  50.24 
 
 
412 aa  338  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  33.69 
 
 
458 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  34.55 
 
 
427 aa  202  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  35.53 
 
 
416 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  35.81 
 
 
448 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  35.81 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  36.73 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  36.12 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  35.2 
 
 
404 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  30.97 
 
 
460 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  41.89 
 
 
797 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  26.47 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  25.99 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  30.43 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  30.86 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  28.04 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  29.18 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  30.94 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  27.74 
 
 
528 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  24.47 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  25.62 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  28.98 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  26.49 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  27.11 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  28.61 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  21.61 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  27.12 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  25.23 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  28.32 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  28.32 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  28.83 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  26.84 
 
 
481 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  29.24 
 
 
608 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  22.57 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  28.17 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  28.32 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  24.36 
 
 
427 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  27.62 
 
 
370 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  22.94 
 
 
420 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  19.89 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  27.24 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  24.05 
 
 
459 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  20.9 
 
 
394 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  28.89 
 
 
380 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  26.56 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  24.87 
 
 
459 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  25.14 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  26.53 
 
 
609 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  26.09 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  27.6 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  34.86 
 
 
436 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  23.29 
 
 
623 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  24.79 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  28.15 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>