180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4577 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
443 aa  874    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  48.55 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  43.8 
 
 
374 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  44.6 
 
 
584 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  51.5 
 
 
259 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  51.5 
 
 
231 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  51.5 
 
 
231 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  39.8 
 
 
236 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  39.35 
 
 
224 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
224 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
223 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  34.63 
 
 
224 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 
238 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  33.65 
 
 
202 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
203 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
212 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
211 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 
232 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
219 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
213 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
220 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
228 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
228 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
228 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
220 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
220 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  28.37 
 
 
214 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
223 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
218 aa  60.5  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.17 
 
 
443 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
233 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
232 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.48 
 
 
229 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 
215 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 
203 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 
215 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
214 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
221 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
221 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
193 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
193 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.87 
 
 
205 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 
213 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 
212 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
221 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 
212 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
223 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
221 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
212 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
217 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
228 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.25 
 
 
220 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.22 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
209 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
223 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 
228 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
220 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
212 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
209 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
213 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.19 
 
 
229 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.19 
 
 
220 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  25.28 
 
 
210 aa  53.5  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
214 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
220 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  26.15 
 
 
219 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
214 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
225 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
202 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  30.19 
 
 
229 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.17 
 
 
444 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
207 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
220 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
230 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 
224 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
220 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
220 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
206 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  30.25 
 
 
195 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.57 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
204 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 
208 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
221 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.05 
 
 
208 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.17 
 
 
442 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  34.07 
 
 
206 aa  50.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
452 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  33.58 
 
 
206 aa  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30 
 
 
442 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.95 
 
 
203 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
216 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
212 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  30.49 
 
 
234 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
209 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
222 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.120144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>