More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2992 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  85.02 
 
 
229 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  76.62 
 
 
230 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  76.62 
 
 
230 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  76.62 
 
 
230 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  72.77 
 
 
250 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  63.25 
 
 
253 aa  278  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  60.68 
 
 
234 aa  271  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  57.94 
 
 
252 aa  254  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  60.18 
 
 
228 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  58.12 
 
 
243 aa  211  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  52.91 
 
 
241 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  56.89 
 
 
255 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  50 
 
 
238 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  47.37 
 
 
239 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  47.06 
 
 
249 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  48.92 
 
 
238 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  47.79 
 
 
228 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  46.7 
 
 
224 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  46.46 
 
 
227 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  45.85 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  44.92 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  49.78 
 
 
241 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  45.31 
 
 
246 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  44.34 
 
 
229 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40.43 
 
 
232 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  42.86 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  46.03 
 
 
261 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  43.86 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  39.66 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  37.97 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  41.8 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  41.18 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  41.39 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  42.29 
 
 
283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  43.4 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  39.15 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  43.16 
 
 
271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.4 
 
 
241 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  43.4 
 
 
250 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  38.1 
 
 
246 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  40.77 
 
 
240 aa  142  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  41.84 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  46.29 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  40.6 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  39.2 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  35.59 
 
 
239 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  36.44 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  37.29 
 
 
242 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  41.7 
 
 
242 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  41.77 
 
 
255 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  40.34 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  35 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  32 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  33.19 
 
 
241 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  36.44 
 
 
242 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  40.51 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  131  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  32.77 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  36.91 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  37.82 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  38.14 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36.91 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  36.32 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  39.57 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.91 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.91 
 
 
243 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  41.6 
 
 
247 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.91 
 
 
243 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.48 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  36.86 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  32.91 
 
 
244 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  43.64 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.66 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  37.92 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  34.84 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  36.48 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  39.61 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  38.46 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  36.09 
 
 
285 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  38.43 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  35.44 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  33.77 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.13 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  36.17 
 
 
249 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  40.16 
 
 
242 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  35.27 
 
 
256 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  39.57 
 
 
253 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  40.46 
 
 
283 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  39.76 
 
 
263 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  38.49 
 
 
256 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  40.46 
 
 
275 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  43.67 
 
 
252 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  43.23 
 
 
252 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  35 
 
 
247 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  35.62 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  40.09 
 
 
255 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  31.67 
 
 
244 aa  122  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  37.19 
 
 
243 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>