54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1126 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  69.93 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  53.74 
 
 		 309 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  53.74 
 
 		 309 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  53.02 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  45.16 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  35.27 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  32.75 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  37.91 
 
 		 664 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.33 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  35.2 
 
 		 681 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  35.2 
 
 		 613 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40.43 
 
 		 588 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  34.64 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  37.69 
 
 		 739 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  36.18 
 
 		 651 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  36.18 
 
 		 679 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.9 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  33.96 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  32 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  27.13 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  32.85 
 
 		 692 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  33.96 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  37.78 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 678 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  33.96 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  28.35 
 
 		 687 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  31.15 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  31.96 
 
 		 559 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  24.67 
 
 		 547 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  29.68 
 
 		 718 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3511  copper resistance D domain-containing protein  43.48 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  33.02 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.82 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 552 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.47 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.21 
 
 		 675 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  25.22 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  33.51 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  33.05 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  34.11 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  25.22 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  32.56 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  33.51 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 578 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  25.22 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  31.21 
 
 		 559 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  25.22 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  31.62 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  25.22 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  25.22 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.27 
 
 		 549 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  34.58 
 
 		 322 aa  42.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  24.78 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>