73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2452 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 96 aa  190  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  71.28 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  65.62 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  65.62 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  62.5 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  57.89 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  65.62 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  53.12 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  65.62 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  44.79 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  47.92 
 
 		 96 aa  90.5  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  63.22 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  55.07 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  62.71 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  39.78 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  43.68 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  42.7 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  47.06 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.04 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  44.12 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  35.87 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  44.59 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 254 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  39.47 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.94 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  37.68 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  47.06 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  40.23 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  43.48 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  41.07 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  36.23 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.07 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  31.52 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  38.89 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  42.42 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  32.95 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  35.29 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  39.13 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  30.67 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 96 aa  42  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  35 
 
 		 99 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  31.71 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  40.28 
 
 		 96 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  33.71 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  25 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  31.88 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>