More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0037 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  100 
 
 
340 aa  685    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  48.8 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  45.45 
 
 
341 aa  232  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1434  histidine kinase internal region  45.73 
 
 
369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  37.75 
 
 
364 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  34.86 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  37.94 
 
 
360 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  35.71 
 
 
343 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  34.02 
 
 
372 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  37.59 
 
 
360 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  37.89 
 
 
358 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  37.54 
 
 
358 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  36.28 
 
 
349 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  41.71 
 
 
360 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3532  histidine kinase internal region  41.52 
 
 
338 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.928574  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1112  putative two-component system sensor protein  35.71 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0563295  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  34.56 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  33.03 
 
 
364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  35.71 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1353  histidine kinase internal region  41.92 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  36.62 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1227  histidine kinase internal region  37.04 
 
 
341 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2665  histidine kinase internal region  35.08 
 
 
355 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3097  histidine kinase internal region  37.28 
 
 
372 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1260  two-component system, sensor protein  37.04 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  45.71 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  36.03 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3313  histidine kinase internal region  35.08 
 
 
355 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.569837  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1948  histidine kinase internal region  34.65 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  hitchhiker  0.00774821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  33.33 
 
 
350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 
367 aa  125  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 
346 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35.56 
 
 
576 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 
578 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.78 
 
 
414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  38.46 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  34.03 
 
 
426 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.86 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  35.92 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  37.2 
 
 
568 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  36.04 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
394 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  31.31 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  39.89 
 
 
420 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
422 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  34.74 
 
 
455 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  32.22 
 
 
342 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  32.04 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  31.16 
 
 
576 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  31.56 
 
 
374 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 
557 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  32.86 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 
557 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 
557 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  30.41 
 
 
607 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  31.49 
 
 
340 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 
360 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  34.08 
 
 
450 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  29.66 
 
 
591 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  34.43 
 
 
358 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 
369 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  28.76 
 
 
557 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0409  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 
249 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  38.85 
 
 
572 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  34.19 
 
 
591 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
585 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  31.88 
 
 
465 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.03 
 
 
589 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.03 
 
 
589 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.03 
 
 
589 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.03 
 
 
589 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.03 
 
 
589 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.03 
 
 
589 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  30.89 
 
 
361 aa  105  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  29.28 
 
 
558 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 
408 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0848  histidine kinase internal region  33.65 
 
 
326 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
384 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  28.32 
 
 
557 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  28.32 
 
 
557 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.03 
 
 
589 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  28.63 
 
 
565 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  28.63 
 
 
565 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
362 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  28.63 
 
 
559 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  28.63 
 
 
559 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  28.63 
 
 
565 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  29.18 
 
 
581 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  31.03 
 
 
522 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  28.63 
 
 
559 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  28.19 
 
 
565 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  28.63 
 
 
559 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  28.63 
 
 
559 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.03 
 
 
589 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 
563 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  29.13 
 
 
579 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  35.94 
 
 
394 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  32.11 
 
 
556 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>