50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3824 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  447  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  99.57 
 
 		 235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  87.44 
 
 		 259 aa  361  6e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  79.71 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  48.06 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  50.24 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  45.77 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  46.23 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  43.41 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  44.33 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  44.33 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  43.14 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  45.13 
 
 		 196 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  46.2 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  47.68 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  47.22 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  40.18 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  45.11 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  45.11 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  45.11 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  42 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  43.81 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  43.81 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  43.81 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  46.05 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  47.95 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  34.76 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  36.59 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  34.07 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  34.3 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  34.3 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  33.76 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  30.77 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  32.6 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  32.44 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  30.69 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  34.59 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.14 
 
 		 386 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  32.81 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  30.05 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  30.05 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  27.73 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  28.44 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  28.44 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  29.53 
 
 		 224 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  33.94 
 
 		 239 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  41.43 
 
 		 229 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>