228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1474 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  54.03 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  56.3 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  55.46 
 
 		 123 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  53.72 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  54.62 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  55.17 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  54.17 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  51.67 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  51.67 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  56.9 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  48 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1379  DGPFAETKE family protein  40.34 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  38.84 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  40.87 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  40.35 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  36.61 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  35.59 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.4 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  37.72 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  39.47 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  33.93 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  37.39 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  38.6 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  37.72 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  35.65 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  35.9 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  36.13 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  32.74 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  37.89 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  40.62 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  30.09 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  45 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  36.9 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  31.9 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  34.82 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  41.43 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  34.65 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  41.18 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  34.75 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  34.74 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  29.09 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  38.57 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  35.8 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  35.9 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  32.14 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  34.78 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  37.36 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2464  YCII-related protein  38.24 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107767  hitchhiker  0.00332743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  38.27 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  35.11 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  25 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  42.42 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  33.68 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  31.96 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  32.99 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  36.92 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  34.41 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  27.97 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  35.2 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  31.58 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  40 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  33.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  34.57 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  40.28 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  45.31 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  40.32 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  34.85 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  43.66 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  39.44 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  34.21 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  29.46 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  28.57 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  31.52 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  36.59 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  30.19 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>