246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1658 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1658  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 
182 aa  358  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1720  20S proteasome A and B subunits  78.69 
 
 
183 aa  263  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 
181 aa  206  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.31 
 
 
183 aa  198  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
178 aa  197  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 
184 aa  197  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
181 aa  195  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.54 
 
 
181 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.11 
 
 
194 aa  191  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
176 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.14 
 
 
182 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
187 aa  191  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
181 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.74 
 
 
180 aa  189  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
181 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.75 
 
 
181 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.71 
 
 
178 aa  189  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.57 
 
 
182 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.75 
 
 
193 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.3 
 
 
183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
180 aa  188  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.18 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.27 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.06 
 
 
178 aa  187  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.75 
 
 
181 aa  187  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
176 aa  186  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
177 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.29 
 
 
177 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 
176 aa  186  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 
174 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 
182 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.06 
 
 
180 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  52 
 
 
176 aa  185  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
176 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
178 aa  184  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
185 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.23 
 
 
185 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  56.18 
 
 
179 aa  184  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 
185 aa  183  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.09 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.81 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.36 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  53.11 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  51.43 
 
 
180 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2694  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.67 
 
 
181 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.937289  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.36 
 
 
186 aa  181  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 
199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.81 
 
 
178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.25 
 
 
174 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
177 aa  180  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.91 
 
 
176 aa  180  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.25 
 
 
174 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.85 
 
 
174 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.85 
 
 
174 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.85 
 
 
174 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
179 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.85 
 
 
174 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.4 
 
 
173 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
176 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
176 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.18 
 
 
176 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.07 
 
 
174 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.43 
 
 
181 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
184 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  51.43 
 
 
204 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.14 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.58 
 
 
206 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.07 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  48.3 
 
 
180 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.53 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  177  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  50 
 
 
188 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.25 
 
 
176 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.66 
 
 
176 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.41 
 
 
181 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>