More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0931 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0931  response regulator receiver protein  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.32 
 
 
1180 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
246 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  33.66 
 
 
224 aa  88.2  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  40 
 
 
233 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  40 
 
 
233 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  40 
 
 
233 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  40 
 
 
233 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  40 
 
 
233 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
229 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  40 
 
 
233 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  40 
 
 
233 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  37.07 
 
 
233 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  40 
 
 
233 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  40 
 
 
233 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 
233 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  38.26 
 
 
234 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 
228 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  40 
 
 
232 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  38.26 
 
 
234 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 
236 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
1012 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.95 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
1736 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6787  CheA signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
790 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.39723 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 
2137 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
989 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
1907 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
989 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
846 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 
232 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
962 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.02 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 
232 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 
232 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
230 aa  80.5  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
941 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 
232 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
224 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1792 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  34.78 
 
 
232 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 
232 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.52 
 
 
230 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1984  threonine dehydratase  38.18 
 
 
418 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.241676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  33.91 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  42.61 
 
 
785 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 
253 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
1125 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 
236 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
974 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  38.53 
 
 
422 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 
234 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.5 
 
 
1197 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
1137 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 
236 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
911 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2695  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  42.02 
 
 
231 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.71 
 
 
239 aa  77.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
977 aa  77.8  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  34.82 
 
 
237 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3145  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00258001  hitchhiker  0.000377263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  39.5 
 
 
239 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.14 
 
 
974 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 
241 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 
231 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  36.13 
 
 
228 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>