144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0111 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 430 aa  862    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.55 
 
 		 422 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  56.71 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  55.39 
 
 		 416 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  57.25 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2116  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  54.72 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  46.76 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.25 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  24.56 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  26.26 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  25.76 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.25 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  25.51 
 
 		 404 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  25.52 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  25.49 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  26.85 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  26.96 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  26.46 
 
 		 545 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  25.77 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  26.27 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  25.71 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  25.06 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  24.82 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  25.3 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  27.61 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  25.36 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  25.24 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  24.86 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  24.86 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  24.22 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  26.15 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  25.36 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  25.12 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  25.57 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  25.12 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  23.66 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  23.77 
 
 		 348 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  23.77 
 
 		 348 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  24.73 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  26.09 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  28.22 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  26.37 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  25.56 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  25.94 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  23.66 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  22.39 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  25.63 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  23.53 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  23.88 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  23.18 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  23.18 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  23.18 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  25.5 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  26.1 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  23.79 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  26.16 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  23.55 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  27.75 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  22.69 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  25.35 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  24.84 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  24.69 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  26.47 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  24.91 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  24.91 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  26.01 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  22.72 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  27.98 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  26.07 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  23.53 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  24.22 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  21.37 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  25.9 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  25.7 
 
 		 356 aa  55.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  24.09 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  25.43 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  25.06 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  25.52 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  21.61 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.09 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  23.91 
 
 		 427 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  23.73 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  25.79 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37018  predicted protein  24.36 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  28.16 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  24.14 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  23.86 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  25.98 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  23.18 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  23.47 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  21.53 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  23.54 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  25 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  22.63 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  25.89 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  21.23 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  25 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  20.78 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  24.04 
 
 		 331 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  21.24 
 
 		 349 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>