More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1783 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  965    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.05 
 
 
476 aa  595  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
469 aa  412  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.67 
 
 
455 aa  389  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
462 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.44 
 
 
488 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.14 
 
 
487 aa  316  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.05 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.65 
 
 
536 aa  310  5e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.67 
 
 
528 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
457 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.35 
 
 
472 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  32.12 
 
 
469 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  32.41 
 
 
466 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.77 
 
 
473 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.69 
 
 
478 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.7 
 
 
475 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.7 
 
 
475 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.7 
 
 
469 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  33.33 
 
 
713 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.84 
 
 
459 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  35.04 
 
 
459 aa  246  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  32.98 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  32.12 
 
 
465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
477 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  30.59 
 
 
475 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.62 
 
 
474 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  30.82 
 
 
469 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  30.45 
 
 
720 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  31.94 
 
 
470 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  31.94 
 
 
470 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  31.94 
 
 
470 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 
458 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  32.47 
 
 
464 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  30.34 
 
 
458 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  31.59 
 
 
470 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  32.49 
 
 
468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
463 aa  222  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  29.7 
 
 
458 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  28.78 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  30.35 
 
 
459 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  34.93 
 
 
462 aa  219  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  29.63 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  31.48 
 
 
716 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  29.41 
 
 
459 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  29.5 
 
 
590 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  31.74 
 
 
716 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  28.54 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  32.03 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  28.54 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  28.51 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.38 
 
 
746 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  29.82 
 
 
458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  28.54 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  27.68 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  27.68 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
458 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.49 
 
 
738 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.46 
 
 
460 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  29.28 
 
 
459 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  30.94 
 
 
453 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.09 
 
 
473 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  30.62 
 
 
467 aa  211  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  29.65 
 
 
458 aa  210  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  31.2 
 
 
487 aa  210  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 
479 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  29.63 
 
 
459 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.98 
 
 
479 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 
463 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  28.11 
 
 
459 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  29.18 
 
 
722 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  29.46 
 
 
507 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  28.48 
 
 
461 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  30.43 
 
 
704 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
470 aa  206  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.91 
 
 
480 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.19 
 
 
479 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
468 aa  205  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.08 
 
 
717 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 
468 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.98 
 
 
479 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.88 
 
 
459 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  29.57 
 
 
516 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
562 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  27.17 
 
 
459 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  29.28 
 
 
515 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  27.17 
 
 
459 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.91 
 
 
480 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  27.17 
 
 
459 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  30.86 
 
 
714 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  31.52 
 
 
745 aa  203  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.04 
 
 
450 aa  203  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.63 
 
 
714 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 
467 aa  202  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.32 
 
 
712 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  29.03 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.4 
 
 
717 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  29.32 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>