44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2273 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  64.71 
 
 		 547 aa  683    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  61.65 
 
 		 557 aa  673    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 553 aa  1121    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  68.69 
 
 		 550 aa  765    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  60.73 
 
 		 551 aa  700    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  49.29 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  48.94 
 
 		 575 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  43.7 
 
 		 551 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  43.41 
 
 		 551 aa  445  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  42.22 
 
 		 556 aa  445  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  43.49 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  42.98 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 		 565 aa  425  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  43.35 
 
 		 575 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  43.01 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  43.01 
 
 		 625 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  41.93 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 		 565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  42.15 
 
 		 556 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  45.84 
 
 		 567 aa  404  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  44.34 
 
 		 565 aa  405  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 517 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  39.5 
 
 		 535 aa  365  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 515 aa  359  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 398 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.77 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2498  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.67 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.14 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2512  hypothetical protein  25.63 
 
 		 452 aa  45.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.55 
 
 		 468 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.87 
 
 		 430 aa  43.9  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>