More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2272 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  100 
 
 
384 aa  756    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  66.93 
 
 
378 aa  522  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  61.1 
 
 
378 aa  473  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  59.11 
 
 
377 aa  461  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  59.9 
 
 
377 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  41.78 
 
 
395 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  41.45 
 
 
393 aa  285  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  38.08 
 
 
415 aa  275  8e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  40.27 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  41.82 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  40.47 
 
 
412 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  40.42 
 
 
370 aa  260  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  40.05 
 
 
366 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  38.28 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  36.51 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  34.75 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  35.54 
 
 
338 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  37.17 
 
 
386 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  35.01 
 
 
337 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  35.62 
 
 
373 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  36.34 
 
 
368 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  33.95 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  34.01 
 
 
376 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  34.39 
 
 
380 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  31.56 
 
 
373 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  30.2 
 
 
370 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.73 
 
 
380 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  31.53 
 
 
404 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  32.99 
 
 
375 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  31.22 
 
 
380 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  32.44 
 
 
383 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  32.13 
 
 
382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  34.74 
 
 
388 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  32.9 
 
 
385 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  33.42 
 
 
377 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.58 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  33.59 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  30.28 
 
 
379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  29.63 
 
 
370 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  40.08 
 
 
239 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  29.47 
 
 
364 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  27.81 
 
 
373 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  29.53 
 
 
381 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  29.21 
 
 
370 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  28.39 
 
 
365 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  32.63 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  31.59 
 
 
373 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  28.42 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.57 
 
 
375 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  27.66 
 
 
383 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  33.69 
 
 
366 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  30 
 
 
366 aa  132  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  37.44 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  27.79 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  26.26 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  27.41 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  27.41 
 
 
374 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  28.86 
 
 
417 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  28.86 
 
 
417 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  31.59 
 
 
373 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.49 
 
 
390 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  32.07 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  27.64 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  27.32 
 
 
403 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  29.24 
 
 
374 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.63 
 
 
396 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  32.14 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  28.17 
 
 
395 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  35.11 
 
 
301 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  31.19 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  28.11 
 
 
381 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  27.32 
 
 
385 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  27.75 
 
 
396 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  27.54 
 
 
397 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  26.85 
 
 
361 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  36.87 
 
 
383 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  33.09 
 
 
258 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  37.3 
 
 
293 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  29.2 
 
 
424 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  30.39 
 
 
285 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  32.94 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  30.56 
 
 
292 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  33.87 
 
 
384 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  38.85 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  32.42 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  27.18 
 
 
431 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  36.67 
 
 
244 aa  90.9  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  32.09 
 
 
272 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  24.55 
 
 
416 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.37 
 
 
769 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  32.52 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  26.7 
 
 
400 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  22.84 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  28.21 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  26.74 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.2 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  27.05 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  25.91 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>