More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2053 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0768  Thimet oligopeptidase  53.52 
 
 		 701 aa  721    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.484964  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  100 
 
 		 660 aa  1353    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  37.62 
 
 		 676 aa  402  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  35.71 
 
 		 681 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  34.05 
 
 		 648 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  34.61 
 
 		 648 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  31.62 
 
 		 676 aa  324  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  33.72 
 
 		 648 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  34.23 
 
 		 644 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  31.73 
 
 		 679 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  31.58 
 
 		 679 aa  316  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  31.63 
 
 		 682 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  31.43 
 
 		 679 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  33.88 
 
 		 679 aa  312  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  32.48 
 
 		 685 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  31.02 
 
 		 679 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  35.15 
 
 		 694 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  31.43 
 
 		 679 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  33.64 
 
 		 675 aa  310  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  31.43 
 
 		 679 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  33.56 
 
 		 683 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  30.72 
 
 		 679 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  31.91 
 
 		 704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  32.13 
 
 		 678 aa  305  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  30.45 
 
 		 679 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  31.13 
 
 		 679 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  32.29 
 
 		 681 aa  304  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  31.13 
 
 		 679 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  31.52 
 
 		 658 aa  301  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  32.14 
 
 		 716 aa  301  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  33.94 
 
 		 679 aa  301  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4613  thimet oligopeptidase  32.42 
 
 		 641 aa  300  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.910564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  29.62 
 
 		 680 aa  299  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  32.18 
 
 		 679 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  33.33 
 
 		 679 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  30.99 
 
 		 655 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  31.55 
 
 		 683 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  33.57 
 
 		 712 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  30.06 
 
 		 682 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  32.25 
 
 		 680 aa  298  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  34.05 
 
 		 686 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  32.18 
 
 		 683 aa  297  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  35.03 
 
 		 683 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  30.27 
 
 		 680 aa  296  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  34.85 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  29.92 
 
 		 679 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  32 
 
 		 685 aa  294  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  34.09 
 
 		 702 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  32.71 
 
 		 682 aa  294  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  32.44 
 
 		 680 aa  294  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  32.97 
 
 		 680 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  31.97 
 
 		 680 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  32.97 
 
 		 680 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  33.33 
 
 		 679 aa  292  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  30.27 
 
 		 678 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  33.27 
 
 		 682 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  31.8 
 
 		 680 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28404  saccharolysin (oligopeptidase)  31.83 
 
 		 687 aa  292  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  34.83 
 
 		 579 aa  292  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  31.8 
 
 		 680 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  32.91 
 
 		 679 aa  292  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  31.8 
 
 		 680 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  31.8 
 
 		 680 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  29.56 
 
 		 680 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  32.93 
 
 		 680 aa  290  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  32.93 
 
 		 680 aa  290  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  32.93 
 
 		 680 aa  290  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  32.93 
 
 		 680 aa  290  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  32.93 
 
 		 680 aa  290  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  31.85 
 
 		 690 aa  290  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  32.93 
 
 		 680 aa  290  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  32.93 
 
 		 680 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  32.63 
 
 		 695 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  32.93 
 
 		 680 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  31.82 
 
 		 680 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  35.45 
 
 		 676 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  32.75 
 
 		 680 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  32.63 
 
 		 695 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  30.88 
 
 		 692 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  33.63 
 
 		 714 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  31.22 
 
 		 680 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  31.1 
 
 		 695 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2614  oligopeptidase A  33.8 
 
 		 685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  30.8 
 
 		 681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  30.97 
 
 		 704 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  34.17 
 
 		 709 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  34.18 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 677 aa  285  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 677 aa  284  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  33.1 
 
 		 695 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  33.1 
 
 		 683 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  30.68 
 
 		 704 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  33.1 
 
 		 695 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  32.1 
 
 		 679 aa  283  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  33.82 
 
 		 695 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  32 
 
 		 679 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  32.54 
 
 		 685 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1779  thimet oligopeptidase  31.73 
 
 		 677 aa  281  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  31.85 
 
 		 695 aa  281  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  29.45 
 
 		 697 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>