More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0945 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  72.48 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  72.48 
 
 		 145 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  72.48 
 
 		 145 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  72.48 
 
 		 145 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  72.48 
 
 		 145 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  71.81 
 
 		 145 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  71.81 
 
 		 145 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  71.81 
 
 		 145 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  71.14 
 
 		 145 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  75.69 
 
 		 145 aa  229  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  72.48 
 
 		 145 aa  225  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  69.59 
 
 		 146 aa  217  8.999999999999998e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  65.1 
 
 		 145 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  65.77 
 
 		 145 aa  197  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.84 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.43 
 
 		 145 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  63.09 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.19 
 
 		 145 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.25 
 
 		 145 aa  190  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  62.16 
 
 		 145 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.54 
 
 		 145 aa  188  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.67 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  59.29 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  63.12 
 
 		 145 aa  185  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  60 
 
 		 154 aa  184  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  60.4 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  57.93 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.33 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.7 
 
 		 147 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.05 
 
 		 144 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  53.69 
 
 		 144 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  57.24 
 
 		 150 aa  173  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  55.63 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.42 
 
 		 274 aa  168  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.17 
 
 		 143 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  51.27 
 
 		 165 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52.7 
 
 		 143 aa  164  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.06 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.06 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.01 
 
 		 143 aa  158  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.1 
 
 		 146 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.62 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 150 aa  147  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.97 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  48.23 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.23 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.23 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  48.25 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  49.62 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  50.72 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  55.8 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  44.06 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  39.57 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.59 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.67 
 
 		 156 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 		 148 aa  84.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.88 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.3 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.88 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.16 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.43 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.36 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  39.42 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.36 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.27 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.84 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.05 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.4 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  40 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  42.55 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  33.33 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.53 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.83 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1284  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.85 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.43 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.45 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.15 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  31.76 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.36 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.09 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  33.04 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.57 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.63 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  32.17 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  34.95 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  34.27 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.79 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.78 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.22 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  38.3 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.3 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>