61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3546 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  898    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  51.06 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  51.89 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  47.29 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  44.23 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  47.36 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  40.05 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  42.47 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  41.23 
 
 		 388 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  41.69 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  40.68 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  40.49 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  29.06 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  31 
 
 		 390 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  29.43 
 
 		 513 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  30.12 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  31.53 
 
 		 513 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  30.96 
 
 		 503 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  29.62 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  31.21 
 
 		 502 aa  123  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  31.78 
 
 		 399 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  28.95 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  29.18 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  29.76 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.64 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  28.02 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  29.88 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  28.41 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  28.26 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  28.13 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  29.26 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  28.75 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  29.56 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  29.79 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  29.71 
 
 		 511 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  30.07 
 
 		 500 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  29.1 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  28.13 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  26.9 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  28.8 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  29.63 
 
 		 502 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  30 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  26.67 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  27.88 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  27.99 
 
 		 389 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  26.36 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  27.19 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  27.94 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  28.27 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  25.61 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1781  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.23 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1425  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  38.89 
 
 		 810 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0494363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.38 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2260  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  43.18 
 
 		 807 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0093  ferredoxin, 4Fe-4S  37.5 
 
 		 124 aa  44.3  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1286  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 138 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.29 
 
 		 217 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.986536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  40.38 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0811  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 140 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0823  formate dehydrogenase beta subunit  29.09 
 
 		 310 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>