More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3202 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  100 
 
 		 129 aa  269  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.66 
 
 		 145 aa  197  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  70.73 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.92 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  69.92 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  71.54 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  67.97 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  68.85 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  67.21 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  64.46 
 
 		 127 aa  167  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.33 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.81 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.69 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  60.16 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  59.17 
 
 		 125 aa  159  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.33 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.85 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  59.17 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  60.94 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  57.5 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.54 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.06 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  60.17 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.28 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  52.8 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  58.73 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.78 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.85 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 291 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  55.46 
 
 		 291 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.94 
 
 		 284 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.94 
 
 		 284 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.94 
 
 		 286 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  55.28 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.22 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.26 
 
 		 309 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  55.65 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.99 
 
 		 283 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.14 
 
 		 277 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.26 
 
 		 281 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  53.17 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.58 
 
 		 298 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.07 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.67 
 
 		 284 aa  127  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  51.2 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  48.74 
 
 		 312 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.79 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.79 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.26 
 
 		 344 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  51.59 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.63 
 
 		 280 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  51.59 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.58 
 
 		 277 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  51.61 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  53.17 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.38 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  51.2 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.2 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  51.61 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  50.85 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  51.2 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.2 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  48.09 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  52.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  52.8 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  52.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  50.4 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  52.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  50.4 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  52.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  48.39 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  52.8 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  52.8 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  52.8 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  52.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  52.38 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  51.59 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.8 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.31 
 
 		 278 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  48.8 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 288 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  52.42 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  52 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  52 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  49.21 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  52 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  53.23 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  52 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>