88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1026 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  98.53 
 
 		 68 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  89.71 
 
 		 68 aa  122  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  83.82 
 
 		 68 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  62.69 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  68.33 
 
 		 63 aa  84.3  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  63.33 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  56.25 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  54.05 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  55.17 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  55.17 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  47.54 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  55.17 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  50 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  50.82 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  45.76 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  51.72 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  49.12 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.33 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  53.33 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46.67 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  41.38 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  41.38 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  49.23 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  48.15 
 
 		 202 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  50 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  42.62 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.9 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.33 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  42.62 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  53.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46.67 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  42.11 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  40.74 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  48.33 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.85 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.18 
 
 		 485 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  51.67 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  40 
 
 		 458 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0483  translation initiation factor IF-2 subunit beta  34.85 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.677558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  32.79 
 
 		 459 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1190  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.9 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  44.83 
 
 		 451 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35.48 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  40.35 
 
 		 204 aa  47.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  40.35 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  39.22 
 
 		 460 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 458 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 458 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  35.59 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  35.59 
 
 		 454 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 458 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  35.59 
 
 		 454 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 460 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  35.59 
 
 		 458 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 457 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  41.07 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.29 
 
 		 455 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  41.07 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  37.04 
 
 		 457 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 471 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  42 
 
 		 455 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  40.74 
 
 		 460 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 468 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2335  translation initiation factor IF-2 subunit beta  30 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3260  23S RNA methyltransferase J  47.54 
 
 		 263 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0985526  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  33.9 
 
 		 454 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.85 
 
 		 562 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  38.18 
 
 		 457 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  27.27 
 
 		 461 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  27.27 
 
 		 461 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 454 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  43.1 
 
 		 448 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  36.51 
 
 		 449 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  43.14 
 
 		 456 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 467 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  34.48 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2170  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.93 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  35.59 
 
 		 407 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0818  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.04 
 
 		 203 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.487297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  29.51 
 
 		 460 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  37.88 
 
 		 559 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  33.93 
 
 		 460 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>