More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1865 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  45.32 
 
 		 203 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  45.07 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  44.76 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  45.07 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 204 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 238 aa  158  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  44.97 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 203 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  42.31 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.32 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  35.55 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  37.31 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  37.43 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  34.11 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.11 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 205 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  35.02 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  38.39 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  37.26 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  36.54 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  33.69 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  33.69 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  40.11 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  35.78 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>