More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0574 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  100 
 
 		 417 aa  822    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  47.62 
 
 		 454 aa  359  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  46.54 
 
 		 455 aa  349  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  46.41 
 
 		 454 aa  349  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  45.11 
 
 		 454 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  46.56 
 
 		 450 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  43.88 
 
 		 454 aa  335  9e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  44.55 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  44.63 
 
 		 450 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.87 
 
 		 452 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.87 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  44.63 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.63 
 
 		 450 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.87 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.97 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  44.15 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.89 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.06 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.33 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  43.47 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.62 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.45 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  41.16 
 
 		 456 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  44.6 
 
 		 462 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.6 
 
 		 462 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.5 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  40.24 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.08 
 
 		 448 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  42.33 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.03 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.63 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.03 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.03 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.8 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  40.62 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.8 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.8 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.8 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  40.19 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  40.33 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  39.95 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  39.95 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  39.95 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  39.95 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  39.95 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  39.95 
 
 		 450 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  39.43 
 
 		 452 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  39.71 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  41.01 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  39.86 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  39.86 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  39.86 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  39.86 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  39.86 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  40.43 
 
 		 451 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  41.1 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  37.23 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.13 
 
 		 450 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  40.24 
 
 		 451 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  38.85 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  40.81 
 
 		 451 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  39.47 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  40.24 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  40.78 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  41.75 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  41.12 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.89 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.89 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  39.9 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  37.62 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.32 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  36.74 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.94 
 
 		 479 aa  264  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  39.48 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  39.48 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  39.24 
 
 		 451 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  37.79 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  37.62 
 
 		 475 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.56 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.79 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  37.56 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.75 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.32 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.5 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  37.56 
 
 		 456 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  40.28 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  36.71 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  40.19 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  34.99 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  36.76 
 
 		 469 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.31 
 
 		 456 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.56 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.76 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.48 
 
 		 450 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  40 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  39.73 
 
 		 462 aa  246  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  34.67 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  37.88 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.79 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>