More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0549 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0549  RNA methyltransferase  100 
 
 
282 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1790  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.61 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2713  RNA methyltransferase  33.2 
 
 
255 aa  166  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2526  putative methyltransferase  33.47 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.583964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  33.71 
 
 
365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  32.45 
 
 
388 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  32.45 
 
 
395 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  32.45 
 
 
388 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  32.48 
 
 
366 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3200  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.62 
 
 
278 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  30.66 
 
 
397 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  29.71 
 
 
349 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01826  tRNA/rRNA methyltransferase  32.35 
 
 
240 aa  98.6  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791566  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  31.97 
 
 
345 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.53 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  28.57 
 
 
382 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  28.47 
 
 
383 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02475  predicted methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.973085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1087  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0787829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1096  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00945167  normal  0.153252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2955  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00122463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2734  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00198303  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  31.6 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  28.83 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  28.4 
 
 
242 aa  89  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1764  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.55 
 
 
262 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.356011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  33.47 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.98 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.77 
 
 
245 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.43 
 
 
246 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.49 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  31.56 
 
 
245 aa  85.5  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  25.82 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.64 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.64 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  34 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.71 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.65 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0299  tRNA/rRNA methyltransferase  30.77 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  34.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.85 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.86 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.06 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  31.5 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  34.09 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.24 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  30.35 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  30.38 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  27.2 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  25.69 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.58 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.41 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  31.55 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.29 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.04 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  29.96 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.76 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.38 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.76 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.03 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.96 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.42 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  26.67 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.66 
 
 
246 aa  79  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.2 
 
 
251 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  28.63 
 
 
248 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  28.98 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  32.4 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.66 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.37 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  31.02 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  33.51 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  31.35 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  28.67 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.2 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  22.82 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.15 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.69 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.52 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.72 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1580  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.02 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.28 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0619  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.64 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  32.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  30.33 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.5 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  29.67 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>