More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03878 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 586 aa  1217    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  58.91 
 
 		 576 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  59.53 
 
 		 576 aa  720    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 		 606 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 		 596 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 		 574 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  39.65 
 
 		 596 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 		 599 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 		 577 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  36.98 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 		 621 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  36.54 
 
 		 580 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 		 571 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  38.78 
 
 		 571 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  35.63 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 		 574 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  36.24 
 
 		 574 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 		 572 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  35.96 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 589 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  34.98 
 
 		 591 aa  353  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 570 aa  346  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 		 610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 548 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  30.77 
 
 		 595 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 		 571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  29.78 
 
 		 559 aa  240  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  29.16 
 
 		 562 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  28.78 
 
 		 556 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  28.41 
 
 		 556 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  28.94 
 
 		 556 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  28.78 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  29.47 
 
 		 565 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  28.91 
 
 		 553 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  27.68 
 
 		 555 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  28.98 
 
 		 555 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  28.25 
 
 		 563 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  29.42 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  28.63 
 
 		 533 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  27.75 
 
 		 529 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 573 aa  209  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  27.27 
 
 		 594 aa  207  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  28.7 
 
 		 582 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 566 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  27.59 
 
 		 580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 700 aa  167  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  32.75 
 
 		 705 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  23.08 
 
 		 667 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.34 
 
 		 666 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 666 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.57 
 
 		 614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  29.87 
 
 		 662 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.83 
 
 		 653 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.57 
 
 		 634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.81 
 
 		 668 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 		 740 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 466 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.2 
 
 		 598 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 468 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 710 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.14 
 
 		 707 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  26.82 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 		 593 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.01 
 
 		 627 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  29.7 
 
 		 583 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  27.5 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.9 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  27.76 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  29.9 
 
 		 672 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 625 aa  101  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.27 
 
 		 666 aa  101  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 473 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  28.68 
 
 		 586 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.68 
 
 		 676 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.44 
 
 		 728 aa  100  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.81 
 
 		 625 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.2 
 
 		 635 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.52 
 
 		 747 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.79 
 
 		 602 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.25 
 
 		 658 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  27.8 
 
 		 658 aa  99.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.37 
 
 		 607 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 581 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.29 
 
 		 1358 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 1479 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.61 
 
 		 662 aa  98.6  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>