47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5821 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  87.34 
 
 		 172 aa  283  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  62.66 
 
 		 173 aa  215  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  62.42 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  62.42 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  59.64 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  59.35 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  46.24 
 
 		 218 aa  157  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  44.26 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  48.68 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  43.98 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  43.21 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  44.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  44.44 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  39.89 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  38.27 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  42.28 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  37.91 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  37.58 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  35.93 
 
 		 499 aa  98.2  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  37.11 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  37.11 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  37.11 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  34.34 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  38.79 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  28.64 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  25.97 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  32.08 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  25.14 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  29.29 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  29.59 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  37.04 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  35.4 
 
 		 664 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  24.32 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  30.1 
 
 		 645 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  25.73 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 320 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  36.71 
 
 		 647 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  28.72 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  33.33 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31.4 
 
 		 637 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 657 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  31.33 
 
 		 373 aa  41.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>