More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4971 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 352 aa  729    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.76 
 
 		 342 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  58.53 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.41 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.94 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.65 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.89 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.47 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.76 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.96 
 
 		 347 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  53.1 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.54 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  48.82 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.16 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.21 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 		 342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.53 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.29 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.44 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.16 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.37 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  45.43 
 
 		 326 aa  279  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.56 
 
 		 510 aa  215  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.65 
 
 		 368 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  36.15 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.15 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.4 
 
 		 459 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 		 501 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  36.68 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.88 
 
 		 724 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  34.34 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.57 
 
 		 315 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.77 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.81 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 319 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  27.71 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  27.19 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  26.77 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  30.71 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  28.53 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.85 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  28.36 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  27.5 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  27.55 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  28.62 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.03 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  28.52 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  28.46 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  29.34 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  28.47 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  26.62 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  28.3 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  28.06 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.08 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  28.52 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  28.66 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  28.44 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>