More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1214 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  313  7e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 160 aa  200  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  58.94 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 		 158 aa  186  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 175 aa  183  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 175 aa  183  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  59.24 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  52.53 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  54.9 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  46.5 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  47.47 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  46.92 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 161 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  43.15 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  44.59 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.51 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  44.23 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  40.79 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  42.66 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 172 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>