More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1715 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1715  patatin  100 
 
 		 310 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000010772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  36.29 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.85 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.74 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  36.17 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.22 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  31.77 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.67 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  37.19 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.77 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  34.17 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.56 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.67 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  30.55 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  33.74 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  33.74 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  34.04 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  41.14 
 
 		 223 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  34.2 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.2 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  33.62 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.89 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  31.2 
 
 		 349 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.48 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.38 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  33.06 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.66 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.58 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.66 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  35.81 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.66 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  32.26 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.79 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.88 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  35.38 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.24 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.24 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.24 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  34.87 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.74 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.76 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.24 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  30.71 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  37.79 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.99 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  32.16 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  32.16 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  32.16 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  30.24 
 
 		 767 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  31.74 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  31.74 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  28.88 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.06 
 
 		 760 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  37.11 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.49 
 
 		 250 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  34.43 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  35.57 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  29.31 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  32.7 
 
 		 804 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.83 
 
 		 803 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  35.91 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  31 
 
 		 813 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.83 
 
 		 803 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.83 
 
 		 803 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  35 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  26.18 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.33 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.06 
 
 		 315 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  32.32 
 
 		 796 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  33.92 
 
 		 707 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.45 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.94 
 
 		 798 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  30.33 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.15 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  35.96 
 
 		 354 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  33.87 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.71 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  37.89 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.91 
 
 		 327 aa  92.8  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.6 
 
 		 728 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.58 
 
 		 263 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.58 
 
 		 263 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.72 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.33 
 
 		 751 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.86 
 
 		 728 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  30.96 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30.52 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.57 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.58 
 
 		 263 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.02 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.02 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.22 
 
 		 733 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  31.65 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.58 
 
 		 263 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30.9 
 
 		 728 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.58 
 
 		 263 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.58 
 
 		 263 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  28.92 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>