More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0173 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 376 aa  781    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3456  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  73.26 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5971  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  73.53 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5644  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  66.13 
 
 		 377 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.457364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6580  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  65.59 
 
 		 377 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852509  normal  0.0314164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3311  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  66.13 
 
 		 377 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.05 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.41 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.36 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  38.81 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.6 
 
 		 761 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.26 
 
 		 781 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  33.07 
 
 		 757 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.82 
 
 		 752 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.51 
 
 		 790 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.59 
 
 		 772 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.77 
 
 		 789 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.43 
 
 		 789 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.33 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.56 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.56 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.56 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.61 
 
 		 789 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.97 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  30.48 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  30.08 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.84 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  30.79 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  28.53 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.14 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  30.34 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  29.62 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.59 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.49 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  28.65 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  30.13 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  32.85 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.58 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.69 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.38 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  29.97 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  33.53 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.79 
 
 		 372 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  31.25 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  30.31 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.19 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.59 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.89 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  32.54 
 
 		 381 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.78 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  28.77 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.99 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  28.46 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.11 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  28.46 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  31.23 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  30.05 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  31.68 
 
 		 388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  33.08 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0143  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.86 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.397791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  28.61 
 
 		 366 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  29.66 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  27.35 
 
 		 366 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.53 
 
 		 382 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  33.96 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  32.87 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.9 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3880  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.59 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3255  glycine cleavage system T protein  30.21 
 
 		 584 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  30.46 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  30.33 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.16 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  27.51 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.14 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3325  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.01 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  29.65 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.82 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.13 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0056  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.21 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  34.16 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.98 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0133  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.91 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  26.68 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  31.15 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  32.64 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0159  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.01 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>