More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1665 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0836  excinuclease ATPase subunit  44.96 
 
 		 862 aa  715    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0955  ABC transporter related  75.93 
 
 		 837 aa  1295    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19390  Excinuclease ATPase subunit  45.64 
 
 		 837 aa  753    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  100 
 
 		 846 aa  1749    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  46.9 
 
 		 843 aa  754    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1467  ABC transporter related  46.64 
 
 		 843 aa  763    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2119  ABC transporter related  47.24 
 
 		 836 aa  752    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.38 
 
 		 834 aa  543  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.5 
 
 		 898 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  34.5 
 
 		 898 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  35.01 
 
 		 877 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36.16 
 
 		 844 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.89 
 
 		 853 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  35.5 
 
 		 850 aa  529  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  33.85 
 
 		 899 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  34.73 
 
 		 838 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  33.81 
 
 		 950 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  33.62 
 
 		 897 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.73 
 
 		 838 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  34.38 
 
 		 838 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.98 
 
 		 832 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  34.99 
 
 		 861 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  35.51 
 
 		 827 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  35.23 
 
 		 848 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  34.85 
 
 		 863 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  35.23 
 
 		 848 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  35.12 
 
 		 848 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  34.88 
 
 		 843 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  35.13 
 
 		 843 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  37.53 
 
 		 776 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  34.62 
 
 		 823 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  33.08 
 
 		 899 aa  512  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  33.7 
 
 		 885 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  34.48 
 
 		 860 aa  509  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  34.01 
 
 		 820 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  34.96 
 
 		 838 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  34.15 
 
 		 822 aa  502  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  34.53 
 
 		 880 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  35.1 
 
 		 944 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  34.62 
 
 		 894 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  34.75 
 
 		 833 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  37.84 
 
 		 942 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  35.25 
 
 		 851 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  37.54 
 
 		 944 aa  489  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  34.71 
 
 		 880 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  38.16 
 
 		 942 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  36.91 
 
 		 939 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  38.49 
 
 		 931 aa  473  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  38.71 
 
 		 954 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  36.91 
 
 		 939 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  38.53 
 
 		 952 aa  472  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  37.86 
 
 		 945 aa  463  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  39.28 
 
 		 945 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  37.36 
 
 		 953 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  37.76 
 
 		 954 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2026  ABC transporter related  35.3 
 
 		 818 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  37.98 
 
 		 963 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  37.9 
 
 		 927 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  36.79 
 
 		 957 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  38.08 
 
 		 951 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  33.49 
 
 		 845 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  35.32 
 
 		 964 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0110  excinuclease ABC subunit A  37.84 
 
 		 943 aa  458  1e-127  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0926  excinuclease ABC subunit A  36.32 
 
 		 967 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0474  excinuclease ABC, A subunit  39.14 
 
 		 946 aa  459  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  36.77 
 
 		 958 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  36.54 
 
 		 936 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  37.64 
 
 		 955 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  37.89 
 
 		 954 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  36.01 
 
 		 956 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  37.69 
 
 		 960 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1015  excinuclease ABC subunit A  36.69 
 
 		 977 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.198775 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  37.34 
 
 		 946 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  36.7 
 
 		 971 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  36.92 
 
 		 958 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  36.54 
 
 		 959 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  33.04 
 
 		 881 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  36.9 
 
 		 954 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3893  excinuclease ABC subunit A  37.85 
 
 		 957 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0649  excinuclease ABC subunit A  37.61 
 
 		 1002 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  37.34 
 
 		 946 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  36.97 
 
 		 980 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18501  excinuclease ABC subunit A  36.65 
 
 		 979 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95453  normal  0.0541711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  36.65 
 
 		 966 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  37.19 
 
 		 916 aa  452  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  37.55 
 
 		 943 aa  449  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  36.99 
 
 		 963 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0831  excinuclease ABC, A subunit  37.64 
 
 		 948 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0795854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  36.6 
 
 		 954 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1601  excinuclease ABC, A subunit  36.92 
 
 		 960 aa  450  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.409115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1444  excinuclease ABC, A subunit  33.14 
 
 		 1889 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21961  excinuclease ABC subunit A  36.83 
 
 		 980 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  37.48 
 
 		 987 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>