More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2280 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  100 
 
 
132 aa  273  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  58.96 
 
 
139 aa  172  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  61.42 
 
 
139 aa  173  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  57.04 
 
 
143 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  58.47 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  58.47 
 
 
144 aa  150  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  58.47 
 
 
144 aa  150  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  58.47 
 
 
144 aa  150  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  58.47 
 
 
144 aa  150  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
140 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  57.63 
 
 
144 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  57.63 
 
 
144 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  57.63 
 
 
144 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  56.9 
 
 
144 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  57.63 
 
 
144 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  57.63 
 
 
144 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
144 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  54.55 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  50.41 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  50.41 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  50.41 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  47.29 
 
 
138 aa  120  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 
136 aa  120  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
139 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  55.96 
 
 
140 aa  116  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  56.14 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  44.03 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  43.2 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  41.6 
 
 
138 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  41.94 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  41.94 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  48.11 
 
 
140 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  48.11 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
130 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 
149 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  42.37 
 
 
131 aa  106  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  49.12 
 
 
139 aa  105  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  39.39 
 
 
142 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
146 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
130 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
130 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  46.09 
 
 
135 aa  103  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  48.04 
 
 
145 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  40.8 
 
 
140 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
137 aa  102  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
141 aa  102  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  42.74 
 
 
131 aa  102  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 
139 aa  102  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  42.97 
 
 
145 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  47.17 
 
 
141 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 
139 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  42.97 
 
 
145 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
145 aa  100  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 
149 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  43.81 
 
 
140 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  46.73 
 
 
107 aa  100  8e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
149 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  47.57 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  47.57 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  47.52 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
139 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  39.68 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1666  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225024  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  44.17 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  40.34 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  46.6 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  43.36 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  46.6 
 
 
142 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.04 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
145 aa  95.9  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  48.04 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  36.72 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 
145 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  43.81 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  47.57 
 
 
139 aa  93.2  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>