238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2064 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  47.92 
 
 
286 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  45.14 
 
 
286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  35.94 
 
 
291 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  36.01 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  34.97 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  35.94 
 
 
291 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  34.62 
 
 
287 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  35.36 
 
 
292 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  33.22 
 
 
292 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  34.62 
 
 
286 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  31.03 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  32.06 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  33.33 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  33.92 
 
 
286 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  33.92 
 
 
286 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  33.57 
 
 
286 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  33.57 
 
 
286 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  32.99 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  32.75 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  30.93 
 
 
295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  30.71 
 
 
295 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  29.03 
 
 
281 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  30.9 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  30.27 
 
 
308 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  31.67 
 
 
285 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.94 
 
 
282 aa  129  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  31.14 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  28.98 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.21 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.36 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  29.45 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  29.17 
 
 
279 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  29.07 
 
 
309 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  29.17 
 
 
279 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  28.52 
 
 
297 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  30.47 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.47 
 
 
281 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  31.51 
 
 
280 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  31.51 
 
 
280 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  31.51 
 
 
287 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  31.51 
 
 
287 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.01 
 
 
281 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  31.51 
 
 
280 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  28.01 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.97 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.57 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  33.8 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.48 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.35 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.68 
 
 
312 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  31.29 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  31.29 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  26.6 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.72 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  28.37 
 
 
283 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  27.4 
 
 
342 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.82 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  30.63 
 
 
290 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.97 
 
 
303 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.76 
 
 
299 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.55 
 
 
280 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  26.95 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  26.26 
 
 
285 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  27.3 
 
 
280 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.11 
 
 
280 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  27.3 
 
 
280 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.05 
 
 
280 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.32 
 
 
281 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  26.6 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  26.6 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  26.6 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  30.93 
 
 
311 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  28.32 
 
 
282 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  26.6 
 
 
280 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  26.6 
 
 
280 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  26.6 
 
 
280 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  27.1 
 
 
278 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  28.87 
 
 
280 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  27.11 
 
 
276 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  29.29 
 
 
285 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  27.82 
 
 
281 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  28.92 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.21 
 
 
280 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.92 
 
 
279 aa  99  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  28.67 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  25 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.72 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  29.02 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.92 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  27.54 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0094  DegV family protein  25.86 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  34.39 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  26.39 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>