More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0401 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0401  gamma-aminobutyrate permease related permease  100 
 
 		 460 aa  918    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.387816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0402  gamma-aminobutyrate permease related permease  62.23 
 
 		 459 aa  581  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000611596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  56.25 
 
 		 457 aa  531  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0542  gamma-aminobutyrate permease or related permease  48.36 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000937541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1480  amino acid permease  48.58 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000231717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1307  gamma-aminobutyrate permease related permease  48.28 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0012668  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1747  gamma-aminobutyrate permease or related permease  48.62 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1517  gamma-aminobutyrate permease  45.09 
 
 		 507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0134  amino acid permease  42.86 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.91384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.15 
 
 		 468 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.17 
 
 		 473 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.15 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.15 
 
 		 468 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.74 
 
 		 470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.96 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.96 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  41.74 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  41.74 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.74 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.74 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.74 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.63 
 
 		 469 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.64 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.19 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.96 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.96 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.96 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  45.91 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.8 
 
 		 474 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.16 
 
 		 470 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.34 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.52 
 
 		 467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  44.47 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  41.26 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  43.94 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  43.94 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.96 
 
 		 471 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.96 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  43.08 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  40.65 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.74 
 
 		 471 aa  329  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1516  amino acid permease-associated region  42.04 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  44.99 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  44.99 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 		 448 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.09 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.63 
 
 		 487 aa  323  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  39.82 
 
 		 466 aa  322  6e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 473 aa  322  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30130  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  39.43 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  38.57 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  40.45 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2200  amino acid permease-associated region  40.83 
 
 		 467 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2394  amino acid permease-associated region  39.76 
 
 		 472 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  39.9 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  39.05 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  39.73 
 
 		 513 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  39.24 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2472  amino acid permease-associated region  38.7 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  41.43 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  36.58 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  36.58 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2383  amino acid permease-associated region  37.06 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  35.71 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  36.58 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2340  amino acid permease-associated region  37.06 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000488972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  36.58 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  36.58 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0967  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695825  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  38.3 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  39.09 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.75 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.75 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.75 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.75 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.53 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.75 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  37.41 
 
 		 467 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  36.3 
 
 		 463 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0933  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 452 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  35.93 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  37.22 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3147  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  38.8 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4288  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  38.15 
 
 		 460 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  40.73 
 
 		 463 aa  289  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 		 468 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  37.87 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  37.87 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  34.78 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  35.05 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  36.99 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  36.99 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>