More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0402 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0402  gamma-aminobutyrate permease related permease  100 
 
 		 459 aa  926    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000611596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0401  gamma-aminobutyrate permease related permease  62.23 
 
 		 460 aa  564  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.387816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  53.63 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0542  gamma-aminobutyrate permease or related permease  47.28 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000937541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1480  amino acid permease  49.02 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000231717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1307  gamma-aminobutyrate permease related permease  49.55 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0012668  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0134  amino acid permease  42.71 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.91384 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1747  gamma-aminobutyrate permease or related permease  46.62 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1517  gamma-aminobutyrate permease  42.83 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.01 
 
 		 473 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.89 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.89 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.91 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.53 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  42.16 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  42.64 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.6 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.61 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 467 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 467 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.96 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.94 
 
 		 470 aa  319  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.94 
 
 		 470 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  41.94 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  41.94 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  41.94 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.64 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.94 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.19 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.29 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  40.71 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  40.71 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  39.47 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  37.97 
 
 		 449 aa  309  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 502 aa  308  9e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  41.58 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1516  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  38.27 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.11 
 
 		 471 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.11 
 
 		 474 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.69 
 
 		 467 aa  306  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.85 
 
 		 471 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2394  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30130  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  39.74 
 
 		 503 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  39.5 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  39.5 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  40.85 
 
 		 462 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3147  amino acid permease-associated region  39.49 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  35.02 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  40.1 
 
 		 466 aa  292  9e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  36.95 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  39.47 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  40.2 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  35.65 
 
 		 475 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  42.18 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  39.33 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  34.56 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  34.34 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  38.82 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  34.34 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  40.56 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  41.62 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  40.56 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  43.09 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  37.77 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  37.77 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  40.56 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  37.77 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  37.77 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  36.28 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  40.56 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  40.56 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  40.56 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  37.77 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  37.77 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  34.77 
 
 		 456 aa  287  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3611  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 		 493 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  38.38 
 
 		 466 aa  286  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  37.77 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  37.77 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  36.87 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>