More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1480 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1480  amino acid permease  100 
 
 		 462 aa  929    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000231717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0542  gamma-aminobutyrate permease or related permease  74.07 
 
 		 463 aa  687    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000937541  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  56.26 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1747  gamma-aminobutyrate permease or related permease  57.72 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0134  amino acid permease  52.28 
 
 		 527 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.91384 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1307  gamma-aminobutyrate permease related permease  54.39 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0012668  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1517  gamma-aminobutyrate permease  51.04 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0401  gamma-aminobutyrate permease related permease  48.58 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.387816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0402  gamma-aminobutyrate permease related permease  49.02 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000611596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.07 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.79 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.23 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.79 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.64 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.06 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.37 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  42.37 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  42.37 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.37 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.76 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.76 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.76 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.37 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.37 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.37 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  42.37 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.52 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.37 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.58 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.75 
 
 		 487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.46 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.06 
 
 		 470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.85 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  44.19 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  43.02 
 
 		 471 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.57 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.57 
 
 		 474 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  42.63 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  42.73 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  44.77 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  41.29 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 		 502 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11719  D-serine/alanine/glycine transporter protein cycA  44.79 
 
 		 556 aa  340  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.636709  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  42.73 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  40.56 
 
 		 473 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1516  amino acid permease-associated region  42.13 
 
 		 469 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  43.3 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  40.62 
 
 		 459 aa  333  6e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  45.54 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  45.54 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  40.35 
 
 		 449 aa  330  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 473 aa  329  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  40 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 463 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 463 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  41.65 
 
 		 475 aa  326  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 463 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  39.78 
 
 		 463 aa  325  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 463 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 463 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  39.78 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  41.9 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  41.9 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  39.35 
 
 		 463 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30130  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  39.83 
 
 		 503 aa  323  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  39.13 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2394  amino acid permease-associated region  38.41 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  39.11 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2472  amino acid permease-associated region  40.43 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  42.14 
 
 		 468 aa  312  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  39.18 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  38.53 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  38.53 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04173  D-alanine/D-serine/glycine permease  44.7 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  36.21 
 
 		 464 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  36.21 
 
 		 464 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  35.99 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  35.99 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  35.78 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2200  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  38.95 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  40.95 
 
 		 513 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  39.22 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  35.9 
 
 		 470 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0056  amino acid permease family protein  43.23 
 
 		 467 aa  302  9e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  37.28 
 
 		 455 aa  302  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0051  amino acid permease family protein  43.45 
 
 		 467 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  35.9 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3147  amino acid permease-associated region  37.3 
 
 		 474 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  35.9 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  35.9 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  35.9 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  35.9 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  37.06 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  37.06 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>