More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1747 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1747  gamma-aminobutyrate permease or related permease  100 
 
 
446 aa  893    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0542  gamma-aminobutyrate permease or related permease  59.87 
 
 
463 aa  544  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000937541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1480  amino acid permease  57.72 
 
 
462 aa  501  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000231717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  54.3 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0134  amino acid permease  49.57 
 
 
527 aa  472  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.91384 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1517  gamma-aminobutyrate permease  50.21 
 
 
507 aa  474  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1307  gamma-aminobutyrate permease related permease  53.78 
 
 
468 aa  471  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0012668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0401  gamma-aminobutyrate permease related permease  48.62 
 
 
460 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.387816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0402  gamma-aminobutyrate permease related permease  46.62 
 
 
459 aa  423  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000611596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.16 
 
 
474 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.59 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.53 
 
 
468 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.53 
 
 
468 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.41 
 
 
473 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  40.72 
 
 
448 aa  342  8e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  41.65 
 
 
452 aa  339  7e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.91 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.91 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.67 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.67 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.91 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.32 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.45 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.14 
 
 
469 aa  336  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.45 
 
 
467 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  40.45 
 
 
470 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  40.45 
 
 
470 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.45 
 
 
470 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  40.45 
 
 
470 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.45 
 
 
470 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.45 
 
 
470 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  40.89 
 
 
459 aa  331  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.91 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.91 
 
 
467 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  44.7 
 
 
453 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  44.7 
 
 
453 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.42 
 
 
482 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2383  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 
459 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  41.22 
 
 
449 aa  324  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2340  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 
459 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000488972  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 
467 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.47 
 
 
470 aa  322  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.6 
 
 
470 aa  322  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 
469 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  39.96 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 
469 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  39.96 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  43 
 
 
449 aa  319  5e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  40.68 
 
 
502 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  41.01 
 
 
461 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.5 
 
 
457 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  37.81 
 
 
458 aa  317  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.41 
 
 
474 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.41 
 
 
471 aa  316  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.41 
 
 
471 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  40.44 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  40.44 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  40.44 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  40.44 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  40.44 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  40.44 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  40.44 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  40.44 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  40.44 
 
 
456 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  38.37 
 
 
475 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  38.82 
 
 
463 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  38.32 
 
 
463 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  39.53 
 
 
467 aa  312  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  39.2 
 
 
455 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  38.1 
 
 
463 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  38.1 
 
 
463 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4318  putative transport protein YifK  39.15 
 
 
460 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0011437  normal  0.877333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  40.23 
 
 
460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  39.22 
 
 
463 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0671  amino acid permease-associated region  39.69 
 
 
453 aa  310  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  39.25 
 
 
473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0933  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 
452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 
463 aa  309  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 
463 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  38.99 
 
 
463 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  38.99 
 
 
463 aa  308  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  38.99 
 
 
463 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  38.99 
 
 
463 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  38.99 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  38.99 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  39.82 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1788  amino acid permease family protein  41.47 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  42.29 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  39.82 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  39.82 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  39.82 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3176  amino acid permease  41.88 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000126504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  39.91 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  39.82 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3459  amino acid permease family protein  41.71 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  39.82 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 
452 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3756  amino acid permease-associated region  39.42 
 
 
452 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0213954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  37.41 
 
 
482 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>