More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4333 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  57.8 
 
 		 844 aa  967    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  58.31 
 
 		 874 aa  996    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  40.78 
 
 		 879 aa  636    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  41.89 
 
 		 945 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  80.05 
 
 		 461 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  100 
 
 		 903 aa  1833    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  76.24 
 
 		 457 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  76.3 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  76.3 
 
 		 461 aa  602  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  75.13 
 
 		 453 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  55.03 
 
 		 1118 aa  602  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  70.9 
 
 		 460 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  71.21 
 
 		 459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  68.15 
 
 		 457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  70.44 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  70.34 
 
 		 451 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  66.1 
 
 		 455 aa  562  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  69.66 
 
 		 452 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  65.71 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  67.86 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  69.11 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  68.61 
 
 		 460 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  68.24 
 
 		 449 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  64.62 
 
 		 468 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  68.95 
 
 		 448 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  68.95 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  67.62 
 
 		 452 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 1381 aa  524  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  41.88 
 
 		 1272 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  67.36 
 
 		 452 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  67.11 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  64.95 
 
 		 474 aa  515  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  55.12 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  54.89 
 
 		 509 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.43 
 
 		 445 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  42.27 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  45.95 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  41.61 
 
 		 585 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.74 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  46.15 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  47.45 
 
 		 444 aa  366  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  43.83 
 
 		 442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  38.73 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  44.88 
 
 		 449 aa  363  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  45.88 
 
 		 456 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.88 
 
 		 449 aa  361  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  43.81 
 
 		 449 aa  361  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  41.23 
 
 		 481 aa  360  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  38.32 
 
 		 610 aa  358  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  38.38 
 
 		 602 aa  358  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  45.36 
 
 		 456 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  45.29 
 
 		 440 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 454 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  45.67 
 
 		 453 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 445 aa  353  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  41.43 
 
 		 453 aa  352  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  45.67 
 
 		 454 aa  351  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  41.48 
 
 		 449 aa  350  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  42.71 
 
 		 447 aa  349  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.83 
 
 		 456 aa  348  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 446 aa  347  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.72 
 
 		 459 aa  346  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  44.88 
 
 		 476 aa  343  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  43.53 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.31 
 
 		 456 aa  343  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  41.51 
 
 		 442 aa  342  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  42.53 
 
 		 462 aa  341  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  40 
 
 		 442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.77 
 
 		 444 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  43.77 
 
 		 439 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  43.01 
 
 		 453 aa  337  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.69 
 
 		 481 aa  336  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  43.83 
 
 		 471 aa  331  3e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  43.83 
 
 		 471 aa  331  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  42.78 
 
 		 453 aa  331  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  41.1 
 
 		 529 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  40.84 
 
 		 441 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  41.45 
 
 		 444 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  43.83 
 
 		 450 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  41.91 
 
 		 463 aa  328  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  43.16 
 
 		 443 aa  327  5e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  41.88 
 
 		 509 aa  327  8.000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  41.29 
 
 		 471 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  42.67 
 
 		 465 aa  323  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.46 
 
 		 461 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  39.13 
 
 		 522 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  70.91 
 
 		 772 aa  318  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  39.05 
 
 		 473 aa  317  6e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  42.9 
 
 		 460 aa  317  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  41.79 
 
 		 457 aa  317  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  41.79 
 
 		 457 aa  317  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  41.01 
 
 		 457 aa  315  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>