More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4006 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 337 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.75 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.31 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.33 
 
 		 317 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.19 
 
 		 317 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.2 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  27.04 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.76 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  26.98 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.49 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  26.07 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  20.13 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  31.52 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.98 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.98 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  30.3 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  20.3 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  24.63 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  29.58 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  29.55 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  19.94 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  29.55 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.85 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  36.31 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  29.61 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.51 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  25.14 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  25.56 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.33 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  24.53 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  27.5 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.29 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>