More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3999 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
411 aa  809    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  83.03 
 
 
400 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  82.22 
 
 
390 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  79.64 
 
 
388 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  80.94 
 
 
393 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.72 
 
 
389 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  79.23 
 
 
389 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.24 
 
 
389 aa  583  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.86 
 
 
389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.96 
 
 
394 aa  565  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.18 
 
 
389 aa  564  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  80.95 
 
 
395 aa  558  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  76.92 
 
 
387 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.53 
 
 
389 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.96 
 
 
392 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.32 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.28 
 
 
387 aa  534  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.36 
 
 
387 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.77 
 
 
387 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  70.8 
 
 
387 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.77 
 
 
387 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.77 
 
 
387 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  68.73 
 
 
387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.76 
 
 
388 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1265  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.43 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200943  normal  0.595801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.95 
 
 
392 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.42 
 
 
392 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.73 
 
 
410 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  67.89 
 
 
393 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.21 
 
 
392 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.71 
 
 
396 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.03 
 
 
388 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3590  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.46 
 
 
386 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.32 
 
 
393 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.68 
 
 
395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.6 
 
 
392 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  63.16 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.43 
 
 
384 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0456  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.7 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00206405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  52.44 
 
 
383 aa  346  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.76 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.29 
 
 
382 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.9 
 
 
382 aa  324  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.48 
 
 
387 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.35 
 
 
379 aa  322  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.94 
 
 
382 aa  316  4e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.42 
 
 
378 aa  315  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.55 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.32 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.49 
 
 
381 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.4 
 
 
382 aa  309  5e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.08 
 
 
389 aa  308  9e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.01 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.01 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.01 
 
 
379 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.42 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.81 
 
 
387 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.21 
 
 
392 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.13 
 
 
385 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.63 
 
 
390 aa  300  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.38 
 
 
382 aa  299  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.21 
 
 
383 aa  298  8e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.46 
 
 
385 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.6 
 
 
392 aa  298  9e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.86 
 
 
384 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.11 
 
 
391 aa  297  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.83 
 
 
387 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.87 
 
 
382 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.08 
 
 
386 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.97 
 
 
384 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.98 
 
 
392 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  41.35 
 
 
395 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.11 
 
 
385 aa  292  7e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.58 
 
 
386 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.32 
 
 
390 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.29 
 
 
389 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.93 
 
 
389 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.84 
 
 
391 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.22 
 
 
387 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.06 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.3 
 
 
387 aa  285  8e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.56 
 
 
386 aa  285  9e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.32 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.22 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.24 
 
 
397 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.97 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.03 
 
 
387 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.04 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.03 
 
 
382 aa  282  8.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.53 
 
 
381 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.71 
 
 
388 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  40.46 
 
 
389 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.62 
 
 
388 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.82 
 
 
388 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.71 
 
 
388 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.24 
 
 
388 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.82 
 
 
388 aa  280  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.24 
 
 
388 aa  280  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>