More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3761 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
523 aa  1009    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  50.38 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.49 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.61 
 
 
511 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  50.1 
 
 
534 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.3 
 
 
525 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  47.64 
 
 
528 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.84 
 
 
509 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  50.28 
 
 
546 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  54.02 
 
 
488 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  47.45 
 
 
531 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.76 
 
 
531 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  47.07 
 
 
512 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.07 
 
 
512 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.07 
 
 
512 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.95 
 
 
520 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.27 
 
 
545 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.37 
 
 
508 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  50.92 
 
 
538 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  50.87 
 
 
531 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.86 
 
 
505 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.1 
 
 
505 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.7 
 
 
515 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  59.04 
 
 
570 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  47.97 
 
 
524 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.19 
 
 
508 aa  356  5e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.64 
 
 
521 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.39 
 
 
532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  52.96 
 
 
542 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  52.4 
 
 
608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.56 
 
 
552 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  47.43 
 
 
501 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.44 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  31.13 
 
 
528 aa  200  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.16 
 
 
512 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  33.86 
 
 
489 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.59 
 
 
465 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.75 
 
 
505 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.44 
 
 
376 aa  120  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  33.01 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.11 
 
 
372 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  34.97 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
405 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
405 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.96 
 
 
415 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.15 
 
 
369 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.74 
 
 
369 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30 
 
 
431 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.42 
 
 
200 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.22 
 
 
370 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.07 
 
 
412 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.22 
 
 
415 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 
369 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.45 
 
 
407 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.37 
 
 
401 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.36 
 
 
431 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.59 
 
 
199 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31 
 
 
400 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  31.16 
 
 
420 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  28.43 
 
 
369 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  32.62 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.49 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  38.73 
 
 
227 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.12 
 
 
418 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.12 
 
 
418 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 
418 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.25 
 
 
430 aa  96.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.68 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.74 
 
 
243 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.15 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.15 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  28.47 
 
 
414 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.78 
 
 
335 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.72 
 
 
406 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.79 
 
 
363 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.59 
 
 
402 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.84 
 
 
207 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.13 
 
 
402 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.06 
 
 
409 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.14 
 
 
338 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  35.9 
 
 
270 aa  92.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  40.24 
 
 
231 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.14 
 
 
407 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  31.18 
 
 
429 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  26.69 
 
 
437 aa  90.9  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  29.14 
 
 
419 aa  90.5  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 
402 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  27.33 
 
 
427 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  29.37 
 
 
431 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.39 
 
 
401 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 
403 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  35.67 
 
 
201 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.48 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  25.84 
 
 
412 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  39.63 
 
 
231 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  29.64 
 
 
440 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.8 
 
 
425 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  36.6 
 
 
205 aa  87.4  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>