56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3697 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3697  hypothetical protein  100 
 
 		 1274 aa  2362    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1506 aa  317  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1400 aa  301  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1499 aa  276  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1413 aa  271  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1392 aa  264  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1407 aa  254  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  31.85 
 
 		 1412 aa  237  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1254 aa  224  9e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1670 aa  181  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0229  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1252 aa  168  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1207 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23940  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1217 aa  108  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  17.57 
 
 		 1622 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  26.55 
 
 		 1983 aa  69.7  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  23.27 
 
 		 1754 aa  69.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  26.12 
 
 		 1980 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.83 
 
 		 1959 aa  66.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  20.71 
 
 		 2013 aa  64.3  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  32.75 
 
 		 1328 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.7 
 
 		 1986 aa  63.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  24.83 
 
 		 2759 aa  62.4  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  27.18 
 
 		 2222 aa  62.4  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2198 aa  60.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1589 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1589 aa  58.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.61 
 
 		 1867 aa  57.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  23.73 
 
 		 1803 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1854 aa  58.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  24.07 
 
 		 2207 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  32.37 
 
 		 1593 aa  56.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  23.63 
 
 		 1958 aa  56.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1823 aa  56.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  28.86 
 
 		 1973 aa  55.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  26.46 
 
 		 1589 aa  55.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  24.87 
 
 		 2204 aa  54.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  29.82 
 
 		 2002 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  24.46 
 
 		 2197 aa  54.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  29.95 
 
 		 2005 aa  54.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  26.17 
 
 		 1945 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  27.71 
 
 		 2016 aa  52.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  29.95 
 
 		 2125 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  29.95 
 
 		 2125 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  29.03 
 
 		 1571 aa  51.6  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.02 
 
 		 1853 aa  51.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  34.25 
 
 		 2096 aa  51.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.58 
 
 		 1877 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 2098 aa  48.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 2101 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.26 
 
 		 1363 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 2101 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  31.58 
 
 		 1328 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  32.89 
 
 		 1822 aa  46.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  25 
 
 		 1296 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3661  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits  46.15 
 
 		 1035 aa  45.8  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27 
 
 		 1861 aa  45.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>