74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1157 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  61.98 
 
 		 199 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  74.31 
 
 		 256 aa  213  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2511  protein of unknown function DUF1003  55.78 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000601993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2791  hypothetical protein  62.87 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0480171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  62.15 
 
 		 177 aa  207  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  65.24 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  67.32 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  64.07 
 
 		 166 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  67.33 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  56.54 
 
 		 175 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  65.13 
 
 		 180 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15340  predicted membrane protein  61.39 
 
 		 262 aa  191  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  62.75 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  62.91 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  61.84 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  58.55 
 
 		 156 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  56.21 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  54.34 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  56.58 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  46.49 
 
 		 188 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  50 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  52.98 
 
 		 167 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  55.7 
 
 		 173 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  48.3 
 
 		 181 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  46.59 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  50.98 
 
 		 296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  44.93 
 
 		 348 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  48.67 
 
 		 176 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  52.9 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  52.9 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  52.9 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  50.31 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  46.67 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  48.84 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  45.26 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  32.12 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  32.03 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  38.75 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  36.25 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  34.91 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  40.26 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  35.05 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  36.52 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  38.46 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  29.13 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  39.53 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  35.85 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  38.75 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  40 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  36.05 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  31.78 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  30.36 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  33.77 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  31.25 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  31.21 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  28.28 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  34.62 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  34.15 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  31.13 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  30.11 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  34.02 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  32.38 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  35.14 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  30.91 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3499  protein of unknown function DUF1003  28.16 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  30.65 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  29.7 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  27.07 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  35.9 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>