More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0983 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  100 
 
 		 322 aa  607  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  54.17 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  37.58 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36.95 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.09 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.59 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44.52 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.37 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  44.52 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.73 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  44.16 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  37.54 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  40.19 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.08 
 
 		 302 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.67 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.21 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  41.22 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  42.21 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  40.8 
 
 		 302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.13 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  37.37 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.13 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  34.55 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  41.81 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  37.62 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.13 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  31.8 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  37.62 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  42 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  38.31 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  38.31 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  38.31 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  38.31 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  38.31 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  39.74 
 
 		 305 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  38.31 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42.76 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  37.79 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.31 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.77 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  38.33 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  31.33 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  35.97 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.97 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  42.21 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40.98 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.88 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  38.46 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.46 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.03 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  35.83 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  33.79 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.49 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  38.31 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  35.86 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  40.6 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  34.92 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  36.88 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  43.92 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  43.92 
 
 		 308 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  41.75 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  39.46 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  36.52 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  43.58 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  40.13 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  39.46 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  40.6 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  31.65 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.12 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  33.78 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  33.11 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  36.03 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  38.8 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  36.88 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  36.86 
 
 		 297 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  33.89 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  33.56 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  35.34 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  31.86 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.33 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  33.56 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  39.8 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  36.84 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  33.56 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  28.43 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  41.89 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  38.05 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  31.67 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  36.88 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  41.64 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  39.47 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  38.7 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  39.47 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  41.64 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>