More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0802 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  59.27 
 
 		 357 aa  335  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  55.79 
 
 		 339 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  55.19 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  53.29 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  50.45 
 
 		 337 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  49.42 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  52.25 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  52.12 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  52.12 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  52.12 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29660  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 		 336 aa  275  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  49.1 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3698  transcriptional regulator, LacI family  51.66 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2719  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  49.55 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  47.2 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  46.25 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  47.45 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  46.55 
 
 		 342 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  46.29 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2867  transcriptional regulator, LacI family  47.6 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0458283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  48.2 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0426  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  50.9 
 
 		 366 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1943  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 347 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2305  transcriptional regulator, LacI family  45.18 
 
 		 349 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  32.24 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  32.15 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  37.54 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  39.23 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.74 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  36.13 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  41.19 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28330  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  33.13 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.33 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  37.06 
 
 		 340 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.74 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  36.09 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  36.39 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  36.76 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.44 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  36.73 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  36.73 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.12 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  39.33 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.63 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.63 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  35.29 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  35.29 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  35.29 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.97 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  34.98 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  35.29 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.93 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  35.06 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.74 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  34.25 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  38.21 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  32.23 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 353 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.63 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  32.43 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  34.15 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  36.83 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  35.69 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.42 
 
 		 352 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  38.23 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  35.47 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>