More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0384 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  100 
 
 		 339 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  43.6 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  40.48 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  38.62 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  41.3 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  38.63 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  37.97 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  43.04 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  36.2 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  32.23 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 340 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  29.84 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  30 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25.28 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  26.67 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.05 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  33.16 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  31.82 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  32.99 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  33.51 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  27.45 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.08 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.08 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.79 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03620  hypothetical protein  29.59 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.82 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  24.29 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  28.08 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2659  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.82 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.82 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  23.67 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  33.83 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0679  catabolite control protein  31.05 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.641859  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  26.84 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0881  transcriptional regulator, LacI family  36.11 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00312464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3098  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.77 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  25.86 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  36.24 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.84 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1497  sucrose operon repressor  27.69 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2491  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.934393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  34.85 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  36.89 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.8 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.43 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2393  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.41 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  7.93999e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.6 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1329  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  29.91 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4217  LacI family transcription regulator  41.24 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1332  transcriptional regulator, LacI family  26.41 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.58 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.96 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0786  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  24.64 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  26.74 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  42.35 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.28 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  27.94 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  36.79 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  22.41 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2803  regulatory protein LacI  47.06 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.578503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>